三界重归安宁后的第七个月圆之夜，混元树突然簌簌颤动，万千枝叶垂落如瀑，将树下休憩的林婉与秦逸笼罩其中。细碎的光点在二人周身流转，凝结成半透明的影像——那是一颗悬浮在虚空中的种子，表皮流转着银河般的璀璨光晕，却在核心处蛰伏着一缕若有若无的暗紫色纹路。
“这是……”林婉伸手触碰，影像如泡影般破碎，混元树的树冠却裂开一道缝隙，将一枚温热的果实送入她掌心。果实表面布满奇异符文，与之前暗渊邪种的纹路形似却透着生机，轻轻摇晃时，竟传出清脆的心跳声。
与此同时，三界各处异象频起。东海深处的龙宫传来警报，沉寂千年的定海神针突然迸发金光，搅动得海水倒卷成通天巨柱；西昆仑之巅，被封印的上古剑阵自行运转，剑气割裂云层，在天幕上划出神秘星图；就连幽冥地府的奈何桥也泛起涟漪，孟婆汤锅中浮现出从未有过的前世今生画面。
“这些异变似乎都与混元树结出的果实有关。”秦逸皱眉，掌心雷火照亮果实表面的符文，“但为何其中会残留暗渊气息？难道暗渊主宰并未被彻底净化？”话音未落，果实突然剧烈震动，一道光束冲天而起，在夜空中投射出无数画面：破碎的星辰重组、熄灭的恒星复燃，而在所有光明景象的边缘，总有一缕黑影如影随形。
为探寻真相，林婉与秦逸决定兵分两路。林婉带着果实返回青鸾宗，借助宗门古籍研究符文奥秘；秦逸则前往雷狱深处，试图从古老雷灵的记忆中寻找线索。青鸾宗禁地内，林婉将果实置于传承大阵中央，阵眼处的青鸾雕像突然睁开双目，口中吐出一卷泛黄的残页。
“混沌初分，阴阳同源，光明暗渊，本为一体……”林婉低声念出残页上的文字，惊觉其中记载的创世秘闻与他们净化暗渊主宰时窥见的景象不谋而合。更令人震惊的是，残页末尾画着与果实符文如出一辙的图案，旁边批注着“鸿蒙新生之种，成则万界兴盛，败则重归混沌”。
另一边，秦逸在雷狱核心找到一位沉睡的古老雷灵。雷灵苏醒时，周身雷霆炸响如万鼓齐鸣，它凝视着秦逸带来的果实投影，浑浊的眼中泛起泪花：“没想到，当年创世神陨落时散落的希望火种，竟在此刻重现。但暗渊余孽未消，这颗种子若被污染……”雷灵不再言语，而是将一段记忆传入秦逸识海。
画面中，太古时期的宇宙正陷入光明与暗渊的永恒之战。创世神以自身为引，将两种力量封印，却在临终前种下一颗希望之种，寄望未来能真正融合阴阳，让宇宙不再有对立与纷争。但暗渊势力暗中布局，企图腐化种子，将其变成毁灭万物的凶器。
就在两人即将拼凑出真相时，三界突然响起刺耳的警报。青鸾宗上空，无数暗紫色乌鸦遮天蔽日，每只乌鸦的瞳孔都倒映着果实的模样；雷狱深处，被封印的暗渊碎片再次躁动，凝聚成狰狞的巨手试图抢夺果实。林婉与秦逸同时意识到，这颗种子早已成为光明与黑暗新的争夺焦点。
“不能让种子落入敌手！”林婉将果实收入乾坤袋，软剑燃起青鸾真火，却发现火焰在接触暗紫色乌鸦的瞬间变得苍白无力。秦逸挥动雷鞭，雷霆却被乌鸦群吸收转化为攻击，二人陷入苦战。千钧一发之际，果实突然自行飞出，悬浮在空中散发柔和光芒。
光芒所过之处，暗紫色乌鸦纷纷褪去邪恶气息，化作普通飞鸟；雷狱中的暗渊巨手也在光芒中崩解。但果实表面的暗紫色纹路却愈发明显，仿佛有一股邪恶力量正在内部苏醒。林婉与秦逸对视一眼，他们知道，真正的挑战才刚刚开始——既要守护这颗承载着宇宙未来的种子，又要防止暗渊余孽的侵蚀，而答案，或许藏在更遥远的未知之地。
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