九十年代的巴塞罗那仍然取得极佳成绩。由克鲁伊夫执教的巴塞罗那由1991年起连夺四届联赛冠军，加上于1992年科曼的入球击败森多利亚，赢得球会的第一个欧冠冠军，故被誉为巴塞历年来的“梦幻队”，也就是梦一队。
当时队中名将如云，由防守的科曼、拉塞尔以至进攻的罗马里奥、萨博尼斯，可谓粒粒皆星。唯一美中不足之处，是球队在1994年欧冠决赛以零比四的大比分惨败于卡佩罗执教的AC米兰，无法再取得另一个欧冠冠军。
随后几年巴萨成绩一直平平无奇，但当球队在1997年夏天由荷兰人范加尔接手后，球队便先后赢得1998及1999年联赛冠军。当时范加尔大量引进荷兰球员，由防守的科库以至前锋的克鲁依维特、范·方卓都是星级荷兰人，被称为「荷兰班底」。可惜范加尔并未能为球会更进一步，起因源于范加尔与球员就战术问题不断争执，影响球队士气。而与部分球星不和亦令范加尔对球员甚有微言。当在2000年西甲中型班拉科鲁尼亚赢得西甲冠军后，巴萨只得第二名，范加尔便宣布辞职，更在记者会上抨击球员毫无素质，没有能力争取佳绩，自此巴萨踏入衰落期，联赛更曾一度跌落至第十五位，连欧冠杯席位都多次失去。
一众巴塞罗那球员一起合照2003年夏天巴萨大改革，拉波尔塔成为俱乐部主席，聘请了荷兰人里杰卡尔德来到俱乐部出任主教练，并收购了巴西超级球星罗纳尔迪尼奥，这标志巴塞罗那的复兴。先于2003至04年球季反弹至第二名，待德科、埃托奥、久利、拉尔森等名将加盟，巴塞更连续两届赢得联赛冠军。
2006年巴塞罗那更是在欧洲冠军杯决赛中击败对手阿森纳，继1992年后第二次夺得该项锦标，但随着更衣室矛盾的一步步升级，巴萨在接下来的两个赛季里一冠未得，梦二王朝在更衣室的漩涡中越陷越深。
2008年夏里杰卡尔德离任，曾经的诺坎普国王瓜迪奥拉走马上任，为了缓解更衣室的矛盾，巴萨果断地送走了梦二王朝的核心小罗和德科，提拔了年仅二十一岁的梅西作为新的核心。重视青训营一直是瓜帅的特色，在拉玛西亚青训营里，瓜帅一举提携了布斯克茨、佩德罗以及召回在曼联不得志的皮克等青训小将，并巩固了伊涅斯塔的主力位置，而这也为巴萨的复兴奠定了基础。在08-09赛季巴萨在瓜迪奥拉的带领下获得了联赛冠军、欧洲冠军和国王杯冠军，并在09-10赛季前半段（2009年）又获得了欧洲超级杯赛、西班牙超级杯和世俱杯，在09年获得了史无前例的六冠王称号，这也标志着巴萨梦三王朝的诞生。
2009-2010赛季之初，巴塞罗那的老冤家皇家马德里新主席弗洛伦蒂诺重新上台，抛出巨资购买了包括C罗、卡卡等世界级巨星，企图重振银河战舰，但是巴塞罗那不畏强敌，赛季之初一路领先，虽然被皇马在中途反超但是后期巴塞罗那再一次超越了皇家马德里，在联赛两次同皇家马德里交手中，巴塞罗那以一比零和二比零双杀对手，这个赛季巴塞罗那虽然没有上个赛季辉煌，但他俨然成为了公认的世界第一足球俱乐部。
2011年5月29日赛季欧洲足球冠军联赛决赛在温布利大球场展开角逐，巴塞罗那三比一取胜曼联，佩德罗先拔头筹，鲁尼一度扳平比分，梅西和比利亚随后破门，巴萨三年内二度取胜曼联，两夺欧冠冠军，历史上第四次夺得欧冠。
自巴萨成立之日起，俱乐部就有自己的队徽。球队成立初期采用的是巴塞罗那市的市徽，只不过他们在市徽上又加上了象征冠军的月桂花冠以及一只蝙蝠，在图案的周围写上了俱乐部的名称和成立日期。
在1910年的时候，巴塞罗那队举办设计队徽公开竞赛，卡洛斯·科马马拉成为俱乐部会徽设计者，他为巴萨设计了沿用至今的队徽。队徽类似锅，后来人们认为在俱乐部队徽上应该加入一些象征着加泰罗尼亚地区的标志，于是就加入了黄红条纹；在队徽的左上边人们还加入了巴塞罗那的守护神圣秋帝的十字架以象征巴塞罗那城；队徽下面的蓝色和红色间条是象征着俱乐部的颜色，最后在红蓝条纹之间又加上了足球。1910年之后，队徽设计改动很少。1949年俱乐部50周年庆典时，右上角的深色条纹恢复；1974年，队徽基本恢复到1910年的设计。2002年，新的队徽面世，由设计师塞拉伊马设计，他取消了F.C.B.中间的点以及侧面的数字，风格更简洁、明快。
2018年9月28日，发布球队全新队徽，拥有现代风格的新队徽有望于赛季正式启用。与此前的队徽相比，新队徽中去除了“FCB”字样，队徽下方的红蓝两色条纹比以往更宽，并且颜色较老队徽更鲜亮。此外，队徽中的足球位置也更靠近中心位置。足球俱乐部此次推出全新队徽是为了更好地适应时代潮流，球队当前使用的队徽是2002年开始启用，从那时到现在，社会与科技都发生了巨大的变化，因此球队队徽也应当与时俱进。此外，新队徽能够更好地适应当下的新媒体潮流，从而提升巴萨的国际化并更好地推动巴萨的品牌战略。
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